La MFR est pilotée par un Conseil d'Administration composé de parents d'élèves, de maîtres de stage, d'anciens élèves... conformément à la loi sur les Associations de 1901.
Le Conseil d'Administration, élu lors de l'Assemblée Générale, impulse la politique de la MFR et suit sa mise en place ainsi que son évolution dans le temps.
Il participe aux différentes assemblées, forums et autres réunions organisés par le mouvement des Maisons Familiales au niveau départemental, régional ou national.
Les parents d'élèves sont toujours les bienvenus au Conseil d'Administration et très attendus pour participer à toutes les activités de la Maison Familiale.